Τα τμήματα ΑΕΙ και το μοναδικό τμήμα ΤΕΙ που εδρεύουν στην πόλη μας παραμένουν ως έχουν μετά και την επίσημη παρουσίαση του νέου σχεδίου «Αθηνά» από το Υπουργείο Παιδείας, Θρησκευμάτων, Πολιτισμού και Αθλητισμού. Στα πλαίσια αυτά ο Βουλευτής Ρεθύμνου της ΝΔ, Γιάννης Α. Κεφαλογιάννης, ο οποίος αισθάνεται δικαιωμένος για την έκβαση της υπόθεσης,προέβη στην ακόλουθη δήλωση:
«Με την ανακοίνωση του σχεδίου «Αθηνά», που αποσκοπεί στην αναδιάρθρωση των ιδρυμάτων ανώτατης εκπαίδευσης της χώρας μας, διαψεύστηκαν με τον πιο ξεκάθαρο τρόπο όλες οι «Κασσάνδρες» που έσπευσαν να καταστροφολογήσουν για άλλη μια φορά, χαρακτηρίζοντας βέβαιη την αναστολή λειτουργίας του παραρτήματος του ΤΕΙ Κρήτης στο Ρέθυμνο, ή ακόμα και την υποβάθμιση του Πανεπιστημίου Κρήτης σε επίπεδο Ρεθύμνου. Στις 02/11/2012 πραγματοποιήθηκε συνάντηση με τον Υπουργό Παιδείας, Θρησκευμάτων, Πολιτισμού και Αθλητισμού, κ. Κ. Αρβανιτόπουλο, για το συγκεκριμένο ζήτημα. Στη συγκεκριμένη συνάντηση, καθώς και στις υπόλοιπες που ακολούθησαν, ο κ. Υπουργός, αφού άκουσε με προσοχή τα επιχειρήματα που του εξέθεσα, δεσμεύθηκε ότι δεν πρόκειται να κλείσει κανένα τμήμα στο Ρέθυμνο, είτε πρόκειται για το Πανεπιστήμιο, είτε για το ΤΕΙ, δέσμευση την οποία, όπως αποδείχθηκε, τήρησε στο ακέραιο.
Προσωπικά, νιώθω απόλυτα δικαιωμένος από αυτή την εξέλιξη και θεωρώ ότι θα συμβάλει τα μέγιστα ως προς τη βελτίωση και την εξέλιξη του παρεχόμενου ακαδημαϊκού έργου. Ως προς τη συνολική μεταρρυθμιστική προσπάθεια, θεωρώ ότι το συγκεκριμένο σχέδιο θέτει τις βάσεις για την ουσιαστική αναδιαμόρφωση της ανώτατης εκπαίδευσης στην Ελλάδα, πολεμώντας στη ρίζα τους φαινόμενα αλληλεπικάλυψης, στρεβλώσεις και παθογένειες πολλών ετών. Χαρακτηριστικά, με το σχέδιο «Αθηνά», από τα 533 τμήματα παραμένουν 386, που αυξάνουν τη δυναμική τους, έτσι ώστε να μπορέσουν να ανταποκριθούν στο ιδιαίτερα απαιτητικό διεθνές ακαδημαϊκό στερέωμα. 
Η κυβέρνηση συνεχίζει το μεταρρυθμιστικό της έργο και προχωράει δυναμικά σε μια νέα εποχή. Από την προσπάθεια αυτή δεν περισσεύει κανένας».
