Τη Δευτέρα 5 Μαΐου 2025 δημοσιεύτηκε στην Εφημερίδα της Κυβέρνησης (ΦΕΚ 2150/Β’/05.05.2025) η απόφαση του Υφυπουργού Παιδείας Θρησκευμάτων και Αθλητισμού, αρμόδιου για την Τριτοβάθμια Εκπαίδευση, κ. Νίκου Παπαϊωάννου, σύμφωνα με την οποία ιδρύεται Πολυτεχνική Σχολή στο Ελληνικό Μεσογειακό Πανεπιστήμιο, με έδρα το Ηράκλειο.
Η Σχολή Μηχανικών καταργείται και στην Πολυτεχνική Σχολή εντάσσονται τα Τμήματα:
- Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών, με έδρα το Ηράκλειο,
- Ηλεκτρονικών Μηχανικών, με έδρα τα Χανιά, και
- Μηχανολόγων Μηχανικών, με έδρα το Ηράκλειο.
Η ίδρυση της Πολυτεχνικής Σχολής με τρία (3) Τμήματα, που έχουν λάβει άριστες αξιολογήσεις από Επιτροπές Εξωτερικής Αξιολόγησης και Πιστοποίησης της Εθνικής Αρχής Ανώτατης Εκπαίδευσης (ΕΘΑΑΕ), ανοίγει νέους δρόμους και υπογραμμίζει με τον πλέον εμφατικό τρόπο τη συνεχώς ανοδική πορεία και ανάπτυξη του Ελληνικού Μεσογειακού Πανεπιστημίου. 
Όλοι οι απόφοιτοι των πενταετών προγραμμάτων σπουδών των παραπάνω Τμημάτων από το 2019 και μετά έχουν δυνατότητα εγγραφής στο Τεχνικό Επιμελητήριο Ελλάδος με πλήρη επαγγελματικά δικαιώματα Διπλωματούχου Μηχανικού στον κλάδο τους.